Použití ultrazvuku přináší pro živé organismy také riziko. Exponované buňky se mohou poškodit:
1. mechanicky - buňky při určitých frekvencích rezonují a trhají se
2. termicky - energie ultrazvuku se při jeho absorbování přemění na teplo
3. chemicky - dochází ke změnám ve struktuře a složení chemických látek, vznikají volné radikály, inaktivují se enzymy
4. excitačně - molekuly se energeticky vzbuzují (podobně jako při ionizaci)
U lidí se po ultrazvukové expozici pozorují výrazné poruchy v krvi, bolest hlavy, únava, mdloby, bušení srdce, narušuje se funkce pohlavních žláz, … Při trvalém působení ultrazvuku může dojít k ochrnutí (smrti).