Další ilustrací použití Hamiltonových rovnic je jejich aplikace na vyšetřování pohybu částice s nábojem e, která se pohybuje v elektromagnetickém poli charakterizovaném skalárním potenciálem
a vektorovým potenciálem
.
Lagrangeova funkce popisující pohyb nabité částice v elektromagnetickém poli (vzhledem ke vztahu (70), který definuje potenciální energii částice) má tvar
| (191) |
který je možné přepsat ve složkách vektorů
a
ve tvaru
| (192) |
Kanonické hybnosti, které odpovídají souřadnicím x, y a z, získáme derivací Lagrangeovy funkce podle zobecněné rychlosti příslušející dané souřadnici. Takže postupně dostáváme
| (193) |
Z kanonických hybností můžeme vyjádřit příslušné zobecněné rychlosti a získáme
| (194) |
Hamiltonián můžeme v tomto případě psát ve tvaru
. Po dosazení ze vztahů (192), (193) a (194) postupně pro hamiltonián uvažované částice pohybující se v elektromagnetickém poli máme ![]()

. Takže hamiltonián lze psát ve tvaru
| (195) |
a i v tomto případě je nezávislý na čase, takže
.